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目前，在水产养殖过程中，滥用药物的现象日趋严重，水产品中的药物残留超标严重影响了水产品质量。我国加入wto后，欧盟对我国水产品的封杀，教训尤其深刻。用生态方法调整、改善、保护鱼类生活的环境，控制、消灭病原；利用生物药剂合理调整水体环境，可达到生态环保的目的。具体措施如下：
1、池塘的清理。冬季干塘捕捞后，排干塘水，结合维修塘堤，清淤、铲除塘边杂草、进行晒塘处理。在开春投放鱼苗前10天左右，用生石灰（每亩150-200公斤）清塘消毒。
2、鱼种的消毒。实践证明，即使健壮的鱼种也难免带有病原体。在鱼种落塘、分塘、转塘、大水面放养前，都应进行鱼体的消毒。消毒前应认真检验鱼体的病原体（镜检），有针对性地采用药浴消毒。
3、定期换注新水。为保持塘水的鲜、活、爽，常换注新水是改善水质环境的有效办法。换注新水的作用是增氧排污，促进池鱼运动，加速新陈代谢；也有利于加速池中饵料生物的增长。水源不方便的，应配备增氧设备，适时开机，调节水中的溶氧，排出有害气体，保持优良的水体环境。
4、合理施用光合细菌。调整水中浮游生物组成结构，分解有害物质，净化水质，减少病害侵袭鱼体。实践证明，施用光合细菌，不但能调节水质，而且还能增加滤食性鱼类的产量，提高养殖效益。
5、定期泼洒生石灰。泼洒生石灰（可作为改良水质的辅助手段，其作用是：杀菌，促进胶体悬浮物凝集，减少有机物耗氧，促使淤泥释放出无机盐类）调整ph值，增加水的肥度，有利于浮游生物繁殖。在养殖期间，每隔20天左右泼洒一次，每亩用量20-30公斤为宜。
6、工具消毒。养鱼的各种工具、网具往往成为传播疾病的媒介，而往往又被人们忽视。一般网具可用10ppm硫酸铜溶液浸洗20分钟，晒干后使用；木制或塑料用具可用5%漂白粉溶液消毒后，在清水中洗净再用。