在马铃薯施肥的时期方法及分配方面，要采用基肥和追肥两种。基肥最好将有机肥与化肥配合施用，才有利于结薯。基肥与追肥中氮磷钾肥料的分配各不相同，一般基肥中只分配50%的氮肥、全部的磷肥和大部分的钾肥。也可以将氮钾肥的一半做基肥，另一半氮钾做追肥；基肥的肥料品种，可以选含磷钾较高（如12%-15%）含氮适当（约10%）的复混肥料，也可以采用单质化肥配合用。单质磷肥最好是普钙，南方酸性土地区也可选钙镁磷肥。磷肥的分配原则是，大部分在起垄前按条或穴状深施于垄底，少部分磷肥种薯块时，施于斜下方。作追施的氮钾肥要到植株顶端现蕾期（即地下块茎形成期）进行追肥，施于垄侧并随即覆土浇水。追肥时间不要过早，最好在薯块进入膨大期进行，过早追肥尤其偏追大量氮肥，会引起地上部旺长地下部结小薯块的问题。在施肥位置上，基肥在种植前沟施或穴施，深度要求15-20厘米左右。追肥在行间或垅侧条施或穴施；肥料埋深5-8厘米，施肥后可以灌水并覆土。
