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黄姜生长期间发生的病害主要有：根腐病（又称茎腐病、枯萎病）、疫病、炭疽病和紫斑病等。根腐病多发生于黄姜出苗前、后的生长前期（3～5月），且较集中或连片发生，是黄姜的常见、多发病，通常导致整株死亡；疫病一般发生于生长前、中期（4～7月），虽然多为局部（较集中，与多雨、湿度大有关）发生，但也可导致整株死亡；炭疽病、紫斑病多发生于黄姜生长中、后期（6～9月），炭疽病在发病区较普遍发生，紫斑病一般少见（有时两病混合发生），危害（以叶片为主）程度一般均较轻（与多雨、荫蔽、湿度大有关）。
1.黄姜根腐病。又称茎腐病、枯萎病，是由真菌类病菌经姜种、土壤、未腐熟的农家肥、雨水、农具等带菌、传播；多雨、湿度大、受冻害、虫伤、连作、黄姜长势弱等均有利于根腐病的发生、蔓延。（1）症状识别。病菌主要侵染地下根状茎幼芽及苗茎基部，芽、茎受害处呈褐或暗褐色斑点（有时为短条斑），凹陷或开裂后腐烂（有时病斑环绕茎基部一圈，导致病斑以上植株萎蔫、枯死）；地下根部新根少或无，地上植株叶片由下向上逐渐变黄枯萎、卷缩，最后枯死（多为整株，叶片一般不脱落），较轻时整株矮小、瘦弱。有时姜苗还未出土或出土不久即芽尖变褐腐烂、死亡。（2）防治措施。进行综合防治，才能取得较好效果。①实行轮作倒茬，且前茬为葱、蒜类更好；重病区应进行2～3年轮作，切莫连作。②精细整地，沟厢配套，高垄栽培；施足已腐熟的农家肥，适时增施磷、钾肥或复合专用肥；雨后要及时清沟排渍，降低田间湿度。③连作地要及时清除植株残枝、叶（烧毁或深埋），并对土壤进行药剂处理：可用绿亨一号3000～4000倍液淋施于种植沟（穴）及盖种土中（拌匀），或每667平方米用敌克松（或50%多菌灵、70%甲基托布津）2～3kg（可加重茬宝lOOg或世高40g）拌细土30～40kg沟施（垫、盖姜种）。对选留无病虫害、须根多、健壮的姜种，在播种前也应作药剂处理：可用50%多菌灵600～800倍液（或70%甲基托布津1000倍，可加根腐灵50g）浸泡姜种10分钟后，捞出晾干待种。④药剂灌根或喷雾（针对苗茎基部）。可选用70%根腐灵 600～800倍液（宜于阴天或晴天傍晚用，可加适量多菌灵或甲基托布津），或绿亨一号4000～5000倍、53.8%可杀得 2000的1000～1200倍、12%绿乳铜（或20%龙克菌）600～800倍、70%甲基托布津600倍、50%多菌灵500倍液等，间隔7～10天，连灌或喷雾2～3次。结合防治地下害虫、叶面喷绿芬威、高产宝等，可促进生长、提高植株抗性和防治效果。
另一类比较少见的是由细菌侵染导致的根腐病，其症状不同点是：受害处多软化、腐烂、有时可闻到臭味，病株病轻时叶片萎垂、卷曲、易落叶（黄化），病重时整株死亡。药剂防治可选用农用链霉素3000～4000倍液，或可杀得1000倍、龙克菌、绿乳铜600倍液等灌根，间隔7天、连治2～3次。对已死病株及时拔除，并铲除病土，撒石灰等消毒。
2.黄姜疫病。属真菌病害，病菌可经病株残体、种姜、未腐熟的农家肥等传带；雨水多、田间湿度大、连作等均有利于此病的发生、蔓延。整体上发生程度低于根腐病，但也可导致整株死亡。（1）症状识别。常常是植株茎部（包括苗茎基部）受害，先是暗绿色、水渍状病斑（有时呈条状），后变褐或变黑、病斑凹陷、甚至环绕茎一圈萎缩，引起病株一侧枝叶或病斑以上整株萎蔫，最后枯死（可较集中或成片发生）；叶片上病斑近圆形、暗绿色，湿度大时叶片软腐。（2）防治措施。药剂防治（其他措施同根腐病）可选用：64%杀毒矾粉剂500倍液，或58%雷多米尔锰锌500～600倍、69%安克锰锌800～1000倍、53.8%可杀得1000～1200倍、12%绿乳铜或20%龙克菌600～800倍、75%百菌清粉剂500倍液等，间隔7～10天、连治2～3次，并喷向整株茎（含基部）上及其地面。
3.黄姜炭疽病、紫斑病。均属真菌病害，病菌可经田间病株残枝、叶、种姜、未腐熟的农家肥等传带；多雨、田间荫蔽、湿度大、连作、氮肥过多、低洼地、积水等均有利于两病的发生、蔓延。其中炭疽病发生较普遍，而紫斑病一般较少见（有时两病混合发生），发生程度一般均不重。（1）症状识别。两病均以侵染叶片为主。炭疽病在叶片上先出现一些水渍状退绿小斑点，后渐扩大成近圆形病斑 （直径多小于4mm），其中散布许多同心轮纹状小黑点，中央呈灰白色、边缘褐色。紫斑病早期症状与炭疽病相似（无同心轮纹），但后期许多病斑常连接或扩大成不规则形的大紫斑（直径多大于10mm），病斑呈深或暗紫色，且多从叶缘向中间扩展；茎上病斑多为小长条形、凹陷，呈红褐或黑褐色。（2）防治措施。药剂防治（其他措施见根腐病）可选用：53.8%可杀得2000的1000～1200倍液，或12%绿乳铜600～800倍、20%噻菌铜（龙克菌）500～700倍、10%世高1000～1500倍、70%甲基托布津或代森锰锌600～700倍、50%多菌灵500倍、75%百菌清粉剂600倍液等喷雾，间隔7～10天、连治2～3次，若喷后遇雨应及时补喷。