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最适储存温度：0℃
相对湿度：95-100%RH
茭白笋采收后，若储存环境温暖，则菰黑穗粉菌很快产生生成熟孢子，笋内黑点越来越大越多，使商品价值降低。此外，茭白笋在20℃的呼吸率可达290mlCO2/公斤/小时，笋组织因代谢作用强，快速消耗体质，组织糖份下降迅速，笋组织疏松。因此，茭白笋收获后，应尽速预冷至5℃以下，并于低温储运的。茭白笋可利用冰水降温，并在0-2℃及95-100%RH储存。带壳的茭白笋因多一层天然保护层，可减少内部失水及见光变绿的现象，有利于储存。若以保鲜膜包裹或以打洞的塑胶带包装，亦能减少失水。
茭白笋储存时，若经光线照射，笋表会出现紫红或绿色色泽，影响外观，因此储存时应尽量避免光线照射。
储存温度（℃） 051015常温（25℃）
储存期限（天）带壳18-219-115-62-31
不带壳12-148-104-62-31。