显而易见，面对GMO食品，目前一个世界的趋势是：对相关食品必须给消费者真实而明确的信息。因此，不论是对GMO食品贴示标签，或是对GMO与非GMO原料的分别输送，GMO原料和食品的检测技术是必不可少的。
GMO检测技术大体可分为两种。一是从DNA入手的PCR法，二是由DNA出发检测蛋白质的ELISA法。对各种检测对象，DNA与蛋白质不同，在检出感度及可检出的品种也有所不同。在PCR法中，因将残存的DNA可增幅到100万倍以上，检出灵敏度高，但也容易引起交叉感染，产生拟阳性的问题，因而必须精心操作。另外，蛋白质因加热产生变性，使检测变得较为困难，许多加工食品，在制造过程中因经加热处理，采用ELISA法有可能无法检出。另一方面，采用DNA的PCR法对热比较稳定，因此即使是对豆腐和油炸豆腐等食品中的DNA的检出也是有可能的。
在采用PCR法中，有定性检测与定量检测两种方式。目前大多以定性检测为主。定性检测的检出范围为0.1％。但是，在定量检测中，以大豆作为检测体中，检出界限可以在0.01％之内，检测精度为99％。在定量检测中，可采用专用的Real－Timep装置，该装置现已有厂家生产出售，但价格较高。
目前，GMO的检测方法多采用Teal－TimePCR装置，检测手段还有许多有待完善的地方。但实际测定，对于在现阶段GMO的混入状况，大豆、玉米等原料的分别输送，以及食品的流通管理均可起到一定的监测作用。
