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2004年4月20日，国家食品药品监督管理局(SFDA)公布了《保健食品注册管理办法》(征求意见稿)，并要求各地药监部门在当年5月15日之前将有关意见回复给药品注册司。
2004年8月上旬，SFDA传来消息，新《保健食品注册管理办法》已经国务院、国家食品药品监督管理局批复，将于年底正式颁布实施。但据消息人士透露，因为一些细节问题需要审慎操作，最终，在今年6月初才正式发布消息，规定新的《保健食品注册管理办法》将在今年7月1日正式开始施行。
“新办法是参照药品注册管理办法制订的，相对于原来卫生部颁布的《保健食品管理办法》及目前执行的注册管理办法发生了一些根本性变化”。中国保健协会秘书长朱康年介绍，以前老的管理办法在细节上很粗糙，虽然不断地有补充文件出台加以完善，但还是难以适应保健品业的健康发展。