一是高标准食用菌生产基地还较少、规模还不大。目前，全市上规模的生产基地还不多，主要集中在爱园、王集、刘集、陇集、耿圩、七雄，小店等乡镇；上标准的食用菌生产专用房只有1000多栋，发展的空间还很大。
二是单产产量不高，效益潜力较大。去年，我市蘑菇平均产量不到2斤／平方尺，福建是4斤／平方尺，河南夏邑3斤／平方尺。
三是生产技术有待进一步提高。主要是：生产者技术不高；技术人员奇缺，尤其是各级农业主管部门同样缺技术人员，指导力不从心；技术储备不足。试验、示范工作不广泛，综合配套技术不完善。对产业发展没有提供强有力的技术支撑。
四是龙头企业带动作用不明显。产业的发展离不开龙头企业的带动，而目前，我市既没有生产龙头企业，也没有大的加工龙头企业。因此，食用菌作为一个产业的发展还很难。让我们有点欣慰的是，宿迁市罐头食品厂已经挑了这副重担，但愿它能为我市食用菌产业的发展作出巨大的贡献。
五是地方财政投入较少。
