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近日，一则广为媒体转载的新闻让益生菌相关产品遭遇了史无前例的质量拷问。这则新闻的源头是，英国《每日电讯报》1月25日援引荷兰乌得勒支大学医学中心发布的消息称，对296个严重胰腺炎病人饲食益生菌临床试验导致24人死亡。为此，荷兰患者和消费者同盟强烈要求有关部门调查含益生菌的乳制品的安全性。荷兰食品与消费品安全管理部门经调查后表示，饮用益生菌乳制品是安全的，消费者大可放心。
虽是虚惊一场，但在全球范围引起了一片哗然。毕竟，这是有史以来首例关于益生菌对健康负面影响的报道。在此之前，消费者饮用益生菌乳制品已经有了上百年的历史，是业界公认的“健康王牌”，不仅企业争相研发相关产品，众多业内专家和科研人员也高度认可其健康功能和营养价值。一份来自中国食品科技学会乳酸菌分会和中国农业大学食品科学与营养工程学院的研究报告指出，益生菌已成为国际研究热点，目前世界各国已发现许多功能菌株，取得大量了科研成果，部分生理功能得到临床证明并应用。
同时，其遭到质疑的安全性也久经考验。据了解，益生菌制品通常作为食品或饮食的补充被人们食用。益生菌是来自于人体和动物肠道的，来源是安全的。另外，大多数益生菌及其产品已经在很多国家被广泛地使用多年，对人体的代谢没有副作用，其安全性广受认可。根据联合国粮食与农业组织和世界卫生组织的共同定义，益生菌是以适当剂量服用时对宿主(人或动物)健康有益的活体微生物制剂，其包括双岐杆菌、嗜热链球菌、嗜酸乳杆菌等种类。而国际营养学界普遍认可的定义是，益生菌是一种对人体有益的细菌，它们可直接作为食品添加剂服用，以维持肠道菌群的平衡。
相对国外而言，益生菌在我国起步时间较晚，相关标准也不够完善。但根据《益生菌类保健食品审评规定》，益生菌菌种必须是人体正常菌群的成员，可利用其活菌、死菌及其代谢产物。益生菌类保健食品必须安全可靠，即食用安全，无不良反应；生产用菌种的生物学、遗传学、功效学特性明确和稳定。卫生部颁布的《新资源食品管理办法》也明确规定，在食品加工过程中使用的微生物新品种需要申请“新资源食品原料”， 微生物新品种依据《新资源食品安全性评价规程》的要求进行各项安全性评价，包括申报资料审查和评价、生产现场审查和评价、人群食用后的安全性评价，以及安全性的再评价。
据中国奶业协会理事、广州市奶业协会理事长王丁棉介绍，益生菌是一种统称，益生菌有上百种菌种，而我国国家规定可纳入日常食品使用的只有十几种，而国内商家常用的只有十种八种，包括乳酸菌、双岐杆菌、嗜酸乳杆菌等。国外常用的菌种也只有十几种，其他菌种能否食用则在研究当中。事实上，近年来在我国食品行业，益生菌已得到了广泛应用，其中90%应用在乳制品中，并且大多用在酸乳制品，包括酸牛奶、酸乳饮料、风味酸乳饮料、奶粉、活性乳、中性调味乳等产品。据统计，2006年乳酸菌饮料市场规模已达25亿元，年总产量突破50万吨，乳酸菌产业规模已超过160亿元。近5年，该品类年发展速度高达25%。
在此同时，国内外商家不遗余力打出“益生菌”旗号，对其产品功能的宣传也是神乎其神———可排毒、预防龋齿、美容、通肠、防癌、减肥以及取代抗生素、补钙、补微量元素、抑制机体衰老等。中国农业大学有关专家认为，一些企业所宣传的益生菌确实对人体有一定的益处。比如，可改善人体的消化吸收；对肠道内的致病菌有抑制作用；能够提高人体的免疫力，还有帮助预防乳糖不耐症等作用。但绝非所有功能均能对号入座，益生菌最基本的保健功能依然是调理肠道，有效促进肠内菌群生态平衡。