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吉林省渔业推进结构调整，紧紧围绕渔业增效、渔民增收，促进了渔业由第一产业向二、三产业转变；调整优化养殖业内部品种、模式和区域布局，其中水产品出口量在全国内陆省份排名继续靠前。
在品种结构方面，鳜鱼、框镜鲤、东北六须鲶等传统优势品种生产规模持续扩大，2007年仅池沼公鱼就生产5000余吨，同时，花羔红点鲑、细鳞鱼、狗鱼等吉林省特色土著品种养殖技术逐步成熟，开始大面积推广；在区域布局方面，逐渐形成了白城、松原等西部地区湖库增养殖业，长春、吉林、四平、辽源等中部地区池塘名优渔业，通化、白山、延边等东部地区冷水渔业的大格局；同时，在总体布局下，又形成了查干湖有机鱼、月亮湖绿色鱼、鸭绿江网箱鱼、东部冷水鱼、延边出口鱼养殖等多个区域亮点；在产业结构方面，渔业二、三产业全面壮大，水产品加工业和休闲渔业快速发展，其产值已占全部渔业产值的半壁江山，与俄罗斯、朝鲜、韩国、日本等国的国际渔业合作逐步深入。
据初步统计，2007年全省水产品总产量可达15万吨，同比增长7.7%；全省开展水产养殖面积32万公顷，繁育水产苗种14亿尾。渔业统计产值突破17.5亿元，同比增长13.3%；渔民人均纯收入达到4500元。
吉林省水产品出口自2002年以来连续5年在全国内陆省份排名前3名，主要集中于延边州珲春、图们等地的转口贸易。与此同时，吉林省渔业资源和环境建设全面推进，促进了渔业可持续发展。各级渔业行政主管部门在松花江、鸭绿江、图们江、辉发河、白山水库、云峰水库、渭源水库等主要江河和重点渔业水域组织开展了22次较大规模的渔业资源增殖放流活动，共投放15个品种5607万尾苗种、210亿粒受精卵，投入资金200余万元，并首次对投放苗种进行苗种检疫和生态安全评估，保证了放流的生态安全。