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近年来云南农作物新品种选育及运用取得重大突破，为云南农业增效、农民增收以及全省粮食安全做出了巨大贡献。
近5年来，云南省级科技计划共列项支持育成主要农作物新品种72个，其应用示范面积4200多万亩，增加产量19.7亿多千克，增加产值近37亿元，其中有16个新品种获国家植物新品种保护授权。生物多样性控制水稻、玉米、小麦等主要农作物病害应用研究共计示范推广2107万亩，减少农药施用量60%，每亩增产40-60千克，新增效益10亿元。
国家级云南花卉星火产业带建设深入推进，截止2007年，云南拥有自主知识产权的花卉新品种达到30个，占全国花卉新品种总数的70%以上，花卉新品种选育处于全国领先地位，云南花卉产业产值年均增幅达20%以上。
另外，选育的“云蔗94-375”通过了国家甘蔗新品种审定，是云南育成的第一个糖能兼用新品种，每年向云南甘蔗区提供甘蔗新品种原种2000吨以上，占云南每年提供原种数量的90%左右，已成为云南新一代甘蔗品种改良的主导种源。