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首先在传播途径上猪流感病毒非常活跃，可由人传染给猪，猪传染给人，也可在人群间传播。人群间传播主要是以感染者的咳嗽和喷嚏为媒介。
而禽流感病毒迄今只能通过禽传染给人，不能通过人传染给人。
普通流感病毒可以在人际间传播，以空气飞沫传播为主，流感患者及隐性感染者为主要传染源。发病后1~7天有传染性，在生病初期的2~3天传染性最强。
在症状方面，三种流感病毒引起的症状较为类似。人类感染猪流感最初出现类似普通流感症状，但体温突然超过39摄氏度，肌肉酸痛感明显增强，伴随有眩晕、头疼、腹泻、呕吐等症状。
人感染禽流感病毒后的症状主要表现为高热、咳嗽、流涕、肌痛等，多数伴有严重的肺炎，严重者心、肾等多种脏器衰竭导致死亡。
与普通流感相比近期出现的新型猪流感病毒和近几年出现的禽流感病毒致死率要高得多。截至目前，全球人感染猪流感死亡率达到6.4%左右。而人感染禽流感死亡率高达60%。
此外，新型猪流感病毒感染患者大多为青壮年，绝大多数在20岁至45岁之间。人禽流感在已发现的感染病例中，13岁以下儿童所占比例较高，病情较重，其属于易感人群。而普通流感的易感人群为老年人、儿童、慢性病患者，以及经常接触流感人群的医护人员。
据介绍，目前普通流感疫苗已经推广使用，禽流感疫苗正在加紧研制的过程中。而新近爆发的猪流感还没有研制出有效的疫苗。