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省、自治区、直辖市食品药品监督管理部门应当在收到申报资料后的5日内对申报资料的规范性、完整性进行审查，符合要求的，予以受理，并在受理后的20日内将申报资料报送国家食品药品监督管理部门。
第十四条 国家食品药品监督管理部门收到申报资料后，应当在120日内组织毒理、功能、理化、微生物及实验室质量管理等相关领域的专家，按照《保健食品试验、检验机构资格认定审核标准》对申报资料进行审查，对申请单位进行现场考核和检查。准予认定的，向申请单位颁发《保健食品试验机构资格认定证书》或《保健食品检验机构资格认定证书》(以下均简称资格认定证书)，并在附页中注明承担的试验或注册检验项目。不予认定的，应当书面通知申请单位并说明理由。同时抄送受理地省、自治区、直辖市食品药品监督管理部门。
资格认定证书有效期为五年。
第十五条 试验、检验机构变迁地址新建的，应当按照本办法重新申请资格认定。
第三章 变更、延续、补发和注销
第十六条 试验、检验机构申请变更资格认定证书及其附页载明内容的，应当填写《保健食品试验机构变更申请表》、《保健食品检验机构变更申请表》，与申报资料一并报送申请单位所在地的省、自治区、直辖市食品药品监督管理部门。
第十八条 对增加试验、注册检验项目的变更申请，省、自治区、直辖市食品药品监督管理部门应当在收到申报资料后的5日内对申报资料的规范性、完整性进行审查，符合要求的，予以受理，并在受理后的20日内将申报资料报送国家食品药品监督管理部门。
第十九条 国家食品药品监督管理部门应当在收到申报资料后的80日内组织与申请变更内容相关领域的专家，按照《保健食品试验、检验机构资格认定审核标准》，对申报资料进行审查，对申请单位进行现场考核和检查。准予变更的，向申请单位颁发变更凭证，并更换资格认定证书的附页；不予变更的，应当书面通知申请单位并说明理由。同时抄送受理地省、自治区、直辖市食品药品监督管理部门。
第二十条 变更凭证的有效期与资格认定证书的原有效期相同。
第二十一条 试验、检验机构需要延续资格认定证书有效期的，应当在资格认定证书有效期届满6个月前向其所在地的省、自治区、直辖市食品药品监督管理部门提出延续申请。
第二十二条 申请延续资格认定证书有效期，申请单位应当填写《保健食品试验机构资格认定证书延续申请表》或《保健食品检验机构资格认定证书延续申请表》，与申报资料一并报送申请单位所在地的省、自治区、直辖市食品药品监督管理部门。
省、自治区、直辖市食品药品监督管理部门应当在收到申报资料后的5日内对申报资料的规范性、完整性进行审查，符合要求的，予以受理，并在受理后的20日内将申报资料报送国家食品药品监督管理部门。
第二十三条 国家食品药品监督管理部门收到申报资料后，应当在80日组织相关领域的专家对申报资料进行审查。符合要求的，准予换证。不符合要求的，应当书面通知申请单位并说明理由。同时抄送受理地省、自治区、直辖市食品药品监督管理部门。
第二十四条 试验、检验机构申请补发资格认定证书的，应当向国家食品药品监督管理部门提出书面申请并说明理由。
因遗失申请补发的，应当提交在全国公开发行的报刊上刊登的遗失声明的原件；因损毁申请补发的，应当交回原资格认定证书原件。经审查，符合要求的，补发资格认定证书，其有效期不变。补发的资格认定证书上应当标注原认定日期，并注明“补发”字样。