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饮用水源地水库最敏感
水利部门介绍，1996年以来广东省有20多座水库出现不同程度的蓝藻水华，其中2000年以来就有18座水库发生蓝藻水华。广东水库发生蓝藻水华的几率、规模以及影响范围均呈加大趋势。江门、惠州、潮州、茂名等地的个别水库先后发生了全库规模的蓝藻水华，严重影响城镇居民饮水安全。
水利部门人士透露，目前不禁止水库养鱼，但在养殖数量、面积上都将有进一步严格规定，但目前尚没有具体细则。在日益增大的环保压力下，各级水利部门纷纷加紧管控，尤其对新提出的承包要求，态度十分谨慎。
事实上，对水库的污染不只是养殖行为，水库周边生产、生活废水对水质的污染更为严重。此前有媒体报道，东莞主要水库水质九成“不及格”，污染源多为工业和生活污染。鹤地水库的水资源也有另外两大污染源，一是库区周边约10万人的生活污水，二是库区周边工厂企业废水源源不断排入鹤地水库。
然而，污染日益严重，水资源质量不断恶化，已引起政府和民众的重视。广东是水库大省，水库水环境状况尤为关键。可以预料，在舆论反映强烈的地方，或水库水质恶化程度严重的地区，为改善饮用水源地水质，地方政府势必收紧水库养鱼的政策，制定更严格的规定与标准。
一般情况下，饮用水源地和大中城市周边水库更易引起政府重视。流溪河水库是广州市唯一的大型水库，其下游水源是广州市重要的饮用水来源。以前，水库曾承包给当地农民进行水产养殖，不少养殖户向水库倾倒粪便或其它饲料进行养殖，造成局部水质污染。广州水利和渔业部门组织力量，多次拆除水库内养鱼网箱，并以政府文件的形式，出台《关于防治水库湖泊污染的通告》，明确规定在经环保行政主管部门批准养殖的水库、湖泊，禁止利用粪便和可能对水体造成严重污染的药物进行水产养殖。这些规定较其他地区更明确，也更严格。
而发生恶性事件后，当地政府必然收紧水库开发利用的要求。南水水库就是因为发现蓝藻水华，有可能威胁乳源居民饮用水安全，当地政府才做出清拆全部网箱的决定。
