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从营养价值来说，两者差异不是很大，都是钙的最佳来源，也是蛋白质、维生素AD和维生素B族的好来源。
从保健效果来说，酸奶更好。它有调节免疫、预防肠道感染疾病、改善胃肠功能的作用，是世界公认的健康食品。
酸奶有利于人类健康和长寿的原因可能有：
1．酸奶可增强人体免疫功能；
2．降低血清胆固醇的水平。有实验证明，甚至在不用任何药物的情况下。每餐饮用约24O克酸奶，一周后可见胆固醇降低。
3.常饮用酸奶能促进肠道运动，缩短食物口一肛转运时间，软化酵解结肠内容物，增加粪便排泄量，预防便秘发生，有益干预防结肠癌。因此，酸奶在国外被誉为长寿食品。
从饱腹感来说，两者都很好。轻微饥饿时喝一杯牛奶或酸奶可以有效缓解迫切的食欲，可减少下一餐的进餐量。但饭后喝都没有减肥效果。
从中医角度说，牛奶可能让某些人上火；还有很多人喝牛奶肚子不舒服，然而酸奶适合于所有人，也不会上火。只要酸奶不太凉，就可以一年四季饮用。
误区：酸牛奶饮料≠酸牛奶
酸牛奶是由优质牛奶经乳酸菌发酵而成，本质上仍属于牛奶，而奶饮料只是饮料的一种，不再是牛奶。两者在本质上有以下区别： 区别之一：营养成分含量差别大。奶饮料的营养只有酸牛奶的1／3。比如，乳品行业规定，100克酸牛奶要求蛋白质含量≥2．9克，调味酸牛奶≥2．3克。而市面上的酸牛奶饮料只有1克左右。 区别之二：口感不同。由于酸牛奶饮料加了水和果汁等，口味没有酸牛奶醇厚，尤其是奶味不足。 区别之三：活性乳酸菌含量。活性乳酸菌是酸牛奶不同于普通牛奶的核心组成部分，具有促进营养吸收、调节胃肠道功能等多种保健功效，其含量和组成直接决定了酸牛奶品质的优劣。一般酸牛奶饮料只含有乳酸而不含有能发酵的活性乳酸菌。有的酸牛奶饮料也含有乳酸菌，但数量甚少。 此外，两者要求的保存条件也不一样。由于需要保持酸牛奶中乳酸菌的活性，真正的酸牛奶要求保存在低温环境，比如标有贮藏条件为2～8摄氏度的要求，而且保存时间一般在1个月以内。而普通酸牛奶饮料保质期限比较长，保存条件也没有那么严格，一般在室温下保存就可以。
