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3月17日，有关媒体刊登了“山西疫苗乱象调查”、“近百名儿童注射疫苗后致死致残”的报道。4月6日，国家卫生部、食品药品监管局联合召开新闻发布会，通报山西“贴签疫苗”事件有关情况。
根据调查组所调查的情况，此前媒体所报道的15名患儿均有疫苗接种史，但均未接种过报道中所说的“贴签疫苗”。15名患儿中，3例患儿所患疾病与疫苗接种有关，按照国务院颁布的《疫苗流通和预防接种管理条例》有关规定，因为预防接种异常反应造成严重健康伤害的，有关方面应该给予一次性的补偿。
卫生部称，有关媒体报道的“贴签疫苗”发生于山西省疾控中心与北京华卫时代公司合作期间的2007年4月至2007年9月（合作从2006年1月至2007年9月），仅涉及我国第二类疫苗（注：第二类疫苗即由公民自费并且自愿受种的其他疫苗。）
2008年11月和2007年11月，中国药品生物制品检定所对山西省相关的“贴签疫苗”进行了相应的抽样检测，结果均符合国家有关药品标准规定。
确认山西省疾控中心与北京华卫时代公司合作经营期间在疫苗管理上存在一定问题，除3月23日山西省人民政府发布会所提及的问题外，还存在未经批准并违反操作技术规程在部分疫苗包装上加贴标签，下发的免疫方案涉及具体疫苗生产企业和疫苗批发企业等问题。北京华卫时代公司与全国卫生产业企业管理协会有关。对于山西省疾控中心与北京华卫时代公司在疫苗经营管理中可能涉及的问题，卫生部和国家食品药品监管局会同山西省正依照法定程序，进行深入调查。