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经过近半个月排查，2011年3月29日，农业部新闻办发布消息称，河南“瘦肉精”案件是个别县市的少数人明知禁用，仍违法生产、销售和使用引起的，属于个案。
农业部新闻办称，目前，河南全省生猪“瘦肉精”排查工作已基本完成，排查共抽检存栏生猪31万头，确认“瘦肉精”阳性生猪134头，检出率为0.04%，且集中在案件发生的孟州、沁阳、获嘉、温县等4县市；“瘦肉精”生产和销售网络也基本查清，对72人采取了强制措施；责任追究工作正在深入开展，已对53 名公职人员进行调查取证，其中12人已移送公安机关。
“瘦肉精”案件发生后，农业部立即启动了生猪市场监测应急预案，开展生猪市场监测日报。根据监测，“瘦肉精”案件在最初一周对河南等地猪肉市场产生了一定的影响，主要是部分地区的小规模户和散养户出现了卖猪难问题。从全国来看，今年以来，生猪生产总体正常，市场供应平稳。
预计上半年生猪价格将保持平稳，随着目前补栏仔猪的逐步育肥出栏，下半年生猪出栏量将有所增加，市场供应充足。
但也有人对农业部数据的能否真实反映中国当下“瘦肉精”使用的真实状况，提出质疑。中国很多地方在生猪屠宰前，并未抽检莱克多巴胺这种新型“瘦肉精”。但从一些研究人员和动物卫生监督人员已经发表的论文来看，违法使用并非个别现象。
“瘦肉精”既包括盐酸克伦特罗这种传统的动物兴奋剂，也包括莱克多巴胺这种新型的动物兴奋剂。中国很多地方在生猪屠宰前仅抽检了盐酸克伦特罗，尚未涉及检测成本更高的莱克多巴胺。即使像浙江宁波这样的经济发达地区，也是在河南“瘦肉精”事件之后，才从本月20日起提前实施莱克多巴胺的检测。
此外，对于深陷“瘦肉精”事件的双汇集团来说，危机远还没有结束。据了解，3月15日双汇发展[0.00 0.00% 股吧]股票跌停，市值蒸发了103亿元，目前事件对销售的影响已经超过了10多亿元。
“瘦肉精”事件亦导致双汇需要延期1个月公布年报，市场分析认为双汇发展的年报营收可能受到济源双汇产品召回的负面影响。双汇“瘦肉精”事件虽然发生在2011年，但事发时双汇发展还未披露2010年年报，属于日后事项，需要在年报的“资产负债表日后事项”中给予说明，因此双汇发展要对年报内容作一些调整；若事件导致公司2010年财务数据变化，则可能利润也需调整。
业内人士认为，农业部的调查结果对于整个行业来说是正面的，但对双汇没有什么意义。现在双汇的屠宰量和销售量都出现了下降，消费者对于双汇品牌的信心并没有恢复。双汇必须“下重手”，包括对每个厂都加强食品安全检验，可能需要半年的时间来进行恢复。