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随着近年来国内饮用水市场需求量的不断增加，政府部门对桶装水的卫生状况越来越关注。然而纵观国内近年的抽样调查来看情况并不乐观。由今年全国各地市工商局和质监局联合公布的不合格桶装水的品种已达上百种，涉及品牌251个，涉及饮用水生产厂家100多家。
其中多数饮用水不合格原因皆为菌落总数超标。最严重的菌落总数超过国家标准9000倍（标准菌落总数应≤50，实测值高达450000）。此外在多种桶装水中还检测出了霉菌和酵母（这是不得检出的细菌污染，如被检测出，需停产整改）民众饮水问题成极大隐患。
上海康久消毒技术公司技术部金大海先生表示：这些桶装水之所以卫生不合格，主要是生产企业忽略了生产用水管道系统、过滤系统、灌装系统的清洗消毒，对饮用水包装物——桶和盖的清洗消毒不彻底也会造成产品被污染，同时，灌装车间的洁净度也会影响水质。饮用过期、不洁的桶装水，可能引发各种水源性疾病，出现腹泻、头晕、恶心等症状。
建议在原水的处理上下好功夫，在产品暴露在空气中的车间内，尽量使用Nicoler原理的动态空气消毒设备实现人机共作业边工作边消毒的生产环境（如，内包车间，灌装车间等）。晚上工人下班后采用静态消毒设备，如臭氧、紫外线等杀菌措施，用以杀灭环境中及物体表面细菌，防止细菌在工人不上班时滋生、繁衍，且臭氧的气味可有效驱赶鼠虫，有效降低生物对纯净水灌装的危害，需要注意的是无论使用臭氧还是紫外线对人体均有危害，需要在工人下班走清后开启，上班前关启，然后开门窗通风及NICOLER动态杀菌机后工人方可进车间。
同时，各企业应建立健全的符合实际的卫生管理制度，特别是针对纯净水生产过程中微生物容易污染的几个重要环节一定要具体到位，保证可操作性，切勿将生产车间的空气消毒流于形式，严格按消毒规范操作，以确保纯净水的卫生质量。