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近年来层出不穷的食品安全事件，令国家食品药品监督管理总局的组建成为本次机构改革中的一大亮点。
昨日，国务委员兼国务院秘书长马凯在说明《关于国务院机构改革和职能转变方案》(下称《方案》)时表示：“现行食品安全监督管理体制，既有重复监管，又有监管‘盲点’，不利于责任落实。药品监督管理能力也需要加强，为进一步提高食品药品监督管理水平，有必要推进有关机构和职责整合，对食品药品实行统一监督管理。”
《方案》提出，将食品安全办的职责、食品药品监管局的职责、质检总局的生产环节食品安全监督管理职责、工商总局的流通环节食品安全监督管理职责整合，组建国家食品药品监督管理总局。主要职责是，对生产、流通、消费环节的食品安全和药品的安全性、有效性实施统一监督管理等。将工商行政管理、质量技术监督部门相应的食品安全监督管理队伍和检验检测机构划转食品药品监督管理部门。保留国务院食品安全委员会，具体工作由食品药品监管总局承担。食品药品监管总局加挂国务院食品安全委员会办公室牌子。不再保留食品药品监管局和单设的食品安全办。
全国政协委员、民建海南省委主委施耀忠向《第一财经日报》表示，我国食品安全事件多发，主要原因是相关部门职能交叉，监管漏洞多。我国涉及食品安全的政府部门有13个，具有行政执法管理职责的政府部门有5个，容易出现食品安全监管的交叉或者空白，难以做到食品安全监管的无缝衔接。
“最开始管食品的只有两个部门，是一个卫生一个是农业，后来经过多次机构改革，食品管理的职能慢慢分散到各个部门，导致多部门监管的现状。”一位不愿透露姓名的食品行业专家表示。
此次的机构调整，将使食品药品的监管职能高度集中到两个部门，即食品药品安全监管总局和农业部。 全国政协委员、中国疾病预防控制中心营养与食品安全所所长、国家食品安全风险评估专家委员会秘书长严卫星在接受《第一财经日报》采访时表示：“这一轮的改革，要讲究专业性、科学性，如果只是行政职能的划分，没有配套，不考虑技术支持方面的调整，还是会存在问题，会造成人财物的浪费。食品安全重复建设比较严重，要最大化地利用好资源，所以这次的调整要进行顶层设计，我们上次的分段监管，就出现了这样的问题，只是动了机关，没有动人。”
严卫星表示，食品安全问题多数是因为违法犯罪的行为，要预防这种行为有一定的难度，它具有不可预见性，比较难以发现。
“目前企业的问题是很大的，特别是诚信问题，这是我们国家违法成本低造成的，诚信体系还没有建立起来，如果违法之后，他就寸步难行，那他就不敢违法了。”严卫星表示。
另外，严卫星表示，在监管队伍上也需要设置准入门槛，目前基层对监管人员没有门槛，什么人都可以去，事实上有些人不具备监管的知识和能力，无法发现食品生产过程中存在的问题。