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在食品流通许可证和餐饮服务许可证两证合一后，山东省食品药品监管局按照新的许可要求开发了食品经营许可服务平台并在全省运行。为进一步规范食品经营许可工作，统一认识、明确标准，山东省局结合全省实际，出台了《食品经营许可工作业务指导》。
《业务指导》对申请材料、证照对应、学校多个分校食堂、健康证明、主体业态选择、食品经营项目归类、用水水质证明、食品经营许可证注销等八个方面作了详细具体的规定，为基层做好食品经营许可改革后的工作提供了基本遵循。
《业务指导》要求实行纸质材料和网上在线申报并存的模式，提供两种服务。一是食品经营学科申请由申请人自行完成。为照顾不熟悉电脑操作的申请人，涉及许可工作人员代申请人填写功能。二是在行政许可受理场所或其他信息发布平台公开申请人需提交的材料等规章制度示范文本。