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水的安全管理水的安全管理主要体现在奶牛饮用水和清洗挤奶设备管道用水。奶牛饮用水同样是奶牛饲养的关键投入品之一，没有符合要求的饮用水和清洗用水，也难保证奶牛的健康，以及挤奶设备管道的安全卫生，影响到生鲜乳的质量和安全。就牧场而言，主要存在下面几个问题：水源源头质量情况不清楚，没有定期地监控。使用自来水的牧场未能向自来水公司索要相关的自来水检测合格材料，同时牧场应该每年取样送相关部门进行检测1次~2次水质，确保奶牛饮用水的安全卫生。
水源源头没有问题，问题在使用过程中，蓄水池卫生很差，内有明显的杂物和微生物生长，水池和饮水管道、设备没有每年定期清洗和消毒，内部污垢较多，清洁的水流容易被污染。
使用深井水，水源有无被污染，以及日常卫生的监测等，不能提供有效的相关监控记录等文件材料，特别是有的井水中泥沙比较多，需要每年对沉淀池、水塔进行淤泥清理、清洗、消毒，并保持相关活动的适当记录。
对井口管理不到位，有地表水进入污染水源，如地表水和雨水的进入可能导致井水水质亚硝酸盐超标。
药品的安全管理牧场药品同样是奶牛饲养的关键投入品之一，药品的安全管理主要是指农药、兽药和清洗消毒剂的安全管理，管理不当会导致奶牛饲（草）料农药残留，以及生鲜乳兽药残留和设备管道清洗、消毒剂的残留，最终影响生鲜乳的安全。一般来说，农药残留主要来源于采购（种植）的饲草以及其中夹带的泥土；兽药残留主要来源于兽医用药；清洗剂、消毒剂残留主要来源于不规范的操作。
牧场通常主要存在下面几个问题：
由于饲草外购为主，一方面，种植过程中对农民农药使用进行有效监督困难较大；另一方面，牧场对农药残留认识不到位，重视程度也不够，缺少农药残留的检测控制。应该提倡和鼓励有条件的牧场，自己配套种植草料，合理有效使用农药，确保草料农药残留得到控制。
兽药仓库管理混乱，没有较好地建立起“账”“物”“卡”三统一管理制度，药品存放也没有很好地定位和标志，只是混乱堆放在一起，使用时很难找。在这样的情况下，出库不能保证按照“先生产先使用”的原则使用，对药品有效期的监管也非常不重视，使用过期药品或接近保质期的药品的事情时有发生。
药品储存中对有储存温度要求的，我们需要提供条件，满足要求。特别需要关心我们存放疫苗的冰箱和温度，冰箱制冷是否正常、温度是否在可控范围，不要因为储存的不当造成疫苗的失效和降效。从实际情况来看，牧场储存药品的冰箱和温度，兽医等相关人员关心得不多，储存温度出现问题的情况也有发生。
关注用药牛只的休药期和治疗后转群、转棚记录不够。兽医在兽药使用过程中还需要关注休药期的天数，用药牛只治疗后转群、转棚交接正常手续，需要能够提供追溯跟踪的原始记录，确保进入正常挤奶牛只药物残留达到相关规定标准。
对挤奶设备管道的清洗、消毒后的清洗剂、消毒剂残留液处理不当或认识不够。往往由于种种原因，操作工清洗、消毒后没有及时排放残留液，或排放时间不够，排放不彻底，也有的是设备管道异常出现的残留死角。特别推广使用食品级的清洗剂、消毒剂，确保生鲜乳的安全。同时牢记，与生鲜乳直接接触的挤奶设备管道的清洗是生鲜乳生产过程中必不可少的部分，生鲜乳生产者必须要经常保持较高的卫生标准，要求达到化学和细菌清洁度，不仅除去全部可见污物，而且还要除去肉眼看不见的，通过消毒获得细菌清洁度，因此，挤奶设备管道表面首先需要用洗涤剂进行彻底清洗，然后再进行消毒，清洗不彻底、不到位，消毒意义和作用就没有了。
挤奶安全卫生管理挤奶安全卫生是牧场生鲜乳质量安全监管的重点工作大家知道，从健康奶牛乳房内挤出的生鲜乳，由于受到挤奶等环节的污染，内在质量安全不可能变得越来越好，牧场要做的是如何降低或减少污染，把生鲜乳的质量安全风险控制在乳品工厂可接受范围。
挤奶过程中通常出现的问题有：牛体污染奶牛的皮毛，特别是腹部、乳房、尾部是微生物附着的严重部位，不洁的牛体所附着的尘埃每克中的细菌数常达几亿至几十亿，牛体所附着的粪块每克可达几亿至上百亿，挤乳前如不清洁牛体或清洁不到位，挤乳时这些脏物极易进入生鲜乳中。牧场需要时刻保持牛床和垫料的干净和干燥，才能做到牛身的清洁。现在多数牧场在炎热夏季，为了奶牛的防暑降温给牛喷淋，导致牛床、垫料以及牛身湿度很大，有的牛身水淋淋的，与保持牛身清洁相矛盾，同时秋后还会给奶牛带来健康问题，此法不是最佳。建议有条件的牧场改用既能够降低牛舍温度，又能够保持牛床和垫料的干净和干燥，运行成本可以接受的新型奶牛防暑降温方案———冷风机。
挤奶员手和擦奶牛乳房使用的毛巾污染由于牛乳房的不清洁，挤奶员的手容易被污染，挤奶时间任务紧，在及时洗手方面有时做的不到位，增加了生鲜乳受大肠杆菌污染的风险；更需要关注的是擦奶牛乳房的毛巾污染。多数牧场使用的毛巾基本情况是本潮挤奶结束，立即清洗、浸泡消毒，下潮挤奶前甩干就使用了，不能保证毛巾的干燥，存在微生物污染的潜在风险。牧场需要配置相关的烘干设备，确保使用毛巾的干燥，降低微生物感染乳房的机会。建议有条件的牧场专人负责毛巾的清洁检查和烘干工作。
挤奶设备污染主要是挤奶设备的日常维护和保养不到位，造成设备的异常，出现清洗死角，加上清洗人员意识不到，不能定期手工拆洗，长期下去出现了设备污染或机械油渗漏污染。建议牧场在保证挤奶设备运转正常的情况下，加强定期拆洗和清洗效果的检查，特别是遇到下雨或牛身比较脏的时候，需要加强检查频次。
生理异常牛只处理奶牛生理异常主要是指初乳期和干奶末梢期，一般牧场都能够严格按照国家有关的标准要求，分离生理异常乳。但是，也有些牧场对初乳控制不严格，或没有经过检测正常后就混进了正常乳，应该干奶的牛只由于配种繁殖的原因，不能如期正常干奶，导致生鲜乳内在质量下降。建议牧场加强生理异常牛只的监管，经过必要的检测，合格后进行合理的转群，并保存相关活动的原始记录备查。
患乳房炎牛只处理一般牧场都能够严格分离，并做到不去正常挤奶厅挤奶，挤出的生鲜乳不进入正常乳。但也有一些小规模牧场管理不严格，患乳房炎牛只也没有分群管理，与正常健康牛只混着挤奶，增加了交叉感染，也使生鲜乳的质量安全受到潜在风险。建议牧场严禁患乳房炎牛只去正常奶厅挤奶，应有专人负责挤奶和奶的处理，确保牧场出售的生鲜乳质量和安全。
生鲜乳的储存运输安全管理生鲜乳的储存运输是生鲜乳由牧场到工厂的中间重点环节，管理不好，将会给牧场和乳品企业带来巨大的经济损失和风险危机。只要牧场控制好，生鲜乳制冷降温速度和储存温度，以及出场时的温度、运输车辆的卫生，其中没有人为的非法行为，就基本能够保证生鲜乳进乳品厂的安全。因此，牧场应该加强出场前的监管，做好储存生鲜乳的温度监测和制冷降温速度监控、出场温度检测的原始记录，并保存备查。同时牧场必须加强对运输车辆卫生的检查，合格的装车，不合格的重新清洗，合格后装车，有铅封要求的认真封存，并做好销售、运输交接单的确认和填写，并收集整理、保存备查。在此过程中常常有如下问题发生：
牧场制冷系统异常、速度慢，不能保证生鲜乳温度达到规定的4℃以下出场。
运输奶槽车卫生没有检查，或对不符合卫生要求的没有及时采取措施。
铅封松紧不适当，存在途中发生断裂或给人“偷梁换柱”等潜在违法活动创造了机会。
运输单或交接单的填写不清楚，特别是铅封有“字”、“编码”要求的，记录不清楚、不正确，以及出售后的资料收集整理、保存不到位。